Um dos pontos da organização dos Jogos que recebeu prioridade no destino de recursos foi o setor de segurança. O plano de segurança do Pan é coordenado pela Secretaria Nacional de Segurança Pública, que é subordinada ao Ministério da Justiça, em parceria com a Secretaria estadual de Segurança. Ao todo são 18 mil agentes entre policiais federais, rodoviários federais, militares e civis, além da Força Nacional de Segurança, que contará com seis mil homens, que virão de todos os estados do Brasil. O plano tem um orçamento de R$ 562 milhões.

No planejamento de segurança para os jogos foram adquiridos 1.500 veículos (motos, viaturas, carros de bombeiros e outros veículos adaptados); 24 novas aeronaves; 18 mil rádios digitais; armamento letais e não-letais; equipamentos antibombas e de perícia; sistema de monitoramento integrado; montagem de oito centros regionais de comando e controle; e contratação de 15 mil agentes de segurança.

Foi criada uma central de inteligência coordenada pela Agência Brasileira de Inteligência (Abin), que está realizando um monitoramento de diversas pessoas e grupos não apenas no Rio de Janeiro, mas em diversos estados do país. O objetivo é identificar qualquer ação criminosa que esteja sendo planejada para os jogos.

Por esses números, o professor de Atletismo no curso de Educação Física na Unisinos, Jorge Teixeira, acha que o trabalho que vem sendo realizado pelos órgãos de segurança irá garantir a realização dos jogos sem incidentes.

No entanto, outros entrevistados manifestaram a preocupação com a segurança no Rio de Janeiro devido aos últimos enfrentamentos entre a polícia e os traficantes.